Orthopoxvirus, nukleiinihapon osoittaminen (kval)

4608 -PoxNhO

Luokittelu

Mikrobiologia, virologia, nukleiinihappotutkimukset

Tiedustelut

Virologian ja immunologian laboratorio, p. 040 659 2117

Indikaatio

Kliininen epäily orthopoxvirusinfektiosta (esim. lehmärokko). Infektiohälytystilanteet (apinarokkoepäily tai isorokkoepäily). Parapoxvirusinfektiota epäiltäessä (esim. ORF-virusten aiheuttama infektio ihmisellä) tilataan lisäksi pyyntö -ZoonNhO, 20857.

Näytteen käsittelyohjeet

Rikotun rakkulan pohjalta tai leesiosta otetaan näyte steriilillä dacron- tai nailontikulla viruskuljetusputkeen (3 ml Copan UTM) tai vaihtoehtoisesti tehdaspuhtaaseen, kierrekorkilliseen muoviputkeen, jossa 1-1,5 ml steriiliä keittosuolaliuosta. Kudospala (muutaman kuutiomillimetrin pala) laitetaan kierrekorkilliseen muoviputkeen pieneen määrään steriiliä fysiologista keittosuolaliuosta tai viruskuljetusputkeen. Kudospalan voi toimittaa myös steriiliin fysiologiseen keittosuolaan kostutetussa sideharsotaitoksessa, joka on suljettu tehdaspuhtaaseen kierrekorkilliseen muoviseen näyteastiaan.

Näyteastia

Katso kohta "Näytteen käsittelyohjeet"

Menetelmä

Nukleiinihapon osoitus PCR-tekniikalla. Orthopoxvirusten tai parapoxvirusten tarkempi tyypitys tehdään tarvittaessa sekvenoinnin avulla. Apinarokkovirukselle käytössä spesifi PCR-testi.

Tekotiheys

Tarpeen mukaan

Tulkinta

Poxvirus-DNA:n löytyminen näytteestä suoraan on diagnostinen löydös.

Huomautukset

Huom. tutkimusta tilattaessa on aina jo ennen näytteenottoa otettava yhteys HUS DGK virologian ja immunologian laboratorioon, virka-aikaan: p. 040 659 2117, virka-ajan ulkopuolella päivystävä laboratoriohoitaja p. 040 837 4010 tai 040 837 4011.

Apinarokkoepäilynäytteet voidaan lähettää kategoria B -kuljetuksena, isorokkoepäilynäytteet vaativat kategoria A -kuljetuksen. Infektiohälytysnäytteitä sisältävien pakettien päälle kirjataan selkeästi merkintä "Infektiohälytys - POX-epäily".

Parapoxvirusinfektiota (esim. ORF-virus) epäiltäessä tilataan -PoxNhO-tutkimuksen lisäksi myös -ZoonNhO-tutkimus (20857), tätä tutkimusta tilattaessa on otettava ennakkoon yhteys tutkivaan laboratorioon (HUSLAB, Virologia).

Asiantuntijoiden yhteystiedot

Tämän tutkimuksen asiantuntijat yhteystietoineen löytyvät tästä linkistä.

Kaikkien asiantuntijoiden yhteystiedot löytyvät Asiantuntijahaku-sivulta.